跑完步小腹疼的原因是：1、剧烈活动造成小肠痉挛。2、伴有先天性扭转的小肠、结肠：剧烈运动时扭转加重，出现肠套叠，可引起腹痛症状。此时除疼痛，还会表现为恶心、呕吐，以及肛门排气、排便停止，腹部明显肿胀等常见的临床症状。
为什么跑完步小腹疼
1、如果患者在运动前吃不易消化的食物，过于剧烈的运动会使大量血液由胃肠道分散到四肢肌肉，从而加重胃肠消化的负担，会使胃肠道出现蠕动功能减弱，伴有痉挛性疼痛。这种情况需要充分休息，适当热敷、按摩腹部，口服山莨菪碱(654-2)等解除肠道痉挛的药物，从而改善小肠痉挛所造成的腹部疼痛症状。
2、跑完前没有做好热身运动：没有做好热身运动会导致身体肌肉和内脏器官不能适应跑步的状态，再加上呼吸急促导致身体不能得到充足的氧气，使呼吸肌变得很紧张，出现痉挛，从而导致跑完步小腹痛。建议患者在跑步前要适当地进行热身运动，避免出现不适症状。